MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32

Total Repeats: 381

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008567	TGT	2	6	6	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008567	A	7	7	20	26	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008567	TTA	2	6	83	88	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008567	CAA	2	6	98	103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008567	AT	3	6	115	120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008567	TGC	2	6	136	141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008567	AT	3	6	157	162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008567	AGAT	2	8	214	221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008567	AGAT	2	8	231	238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008567	AT	3	6	237	242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008567	TTA	2	6	284	289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008567	TTA	2	6	300	305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008567	AGA	2	6	350	355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008567	T	7	7	403	409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008567	TTA	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008567	GAT	2	6	456	461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008567	ATCA	2	8	469	476	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008567	ATAA	2	8	494	501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008567	TAA	2	6	510	515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008567	GAA	2	6	518	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008567	A	6	6	533	538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008567	T	6	6	549	554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008567	A	6	6	566	571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008567	ACT	2	6	582	587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008567	T	6	6	1257	1262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008567	A	6	6	1276	1281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008567	TA	3	6	1284	1289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008567	GTA	2	6	1306	1311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008567	ATTT	2	8	1348	1355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008567	TAA	2	6	1388	1393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008567	AAT	2	6	1445	1450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008567	ATT	2	6	1464	1469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008567	TATT	2	8	1471	1478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008567	TAT	2	6	1505	1510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008567	TGA	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008567	TAAA	2	8	1630	1637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008567	GAG	2	6	1665	1670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008567	AATTT	2	10	1672	1681	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008567	T	6	6	1687	1692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008567	A	6	6	1697	1702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008567	ATA	2	6	2123	2128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008567	CT	3	6	2133	2138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008567	AATT	2	8	2153	2160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008567	AGAT	2	8	2190	2197	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008567	T	7	7	2411	2417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008567	AG	3	6	2832	2837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008567	TGT	2	6	2864	2869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008567	TAA	2	6	3083	3088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008567	A	6	6	3087	3092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008567	ATTA	2	8	3094	3101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008567	TTA	3	9	3111	3119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008567	ATT	2	6	3125	3130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008567	TAA	2	6	3132	3137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008567	ATA	2	6	3154	3159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008567	TTTA	2	8	3200	3207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008567	A	7	7	3224	3230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008567	A	6	6	3233	3238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008567	TAT	2	6	3248	3253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008567	A	7	7	3274	3280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008567	TA	3	6	3293	3298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008567	A	6	6	3310	3315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008567	AAT	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008567	ATT	2	6	4141	4146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008567	AAAT	2	8	4147	4154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008567	AAAAT	2	10	4335	4344	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008567	A	7	7	4377	4383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008567	ATG	2	6	4394	4399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008567	TTAT	2	8	4455	4462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008567	A	6	6	4477	4482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008567	TTAATT	2	12	4788	4799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008567	T	7	7	4798	4804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008567	T	7	7	4817	4823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008567	T	7	7	4852	4858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008567	AT	3	6	4859	4864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008567	AT	3	6	4893	4898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008567	TTTCA	2	10	4913	4922	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_008567	T	6	6	4951	4956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008567	TTA	2	6	4979	4984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008567	TAT	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008567	A	6	6	5031	5036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008567	AATTA	2	10	5045	5054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008567	A	7	7	5054	5060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008567	TAAA	2	8	5061	5068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008567	AAT	2	6	5097	5102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008567	AGC	2	6	5112	5117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008567	AT	3	6	5125	5130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008567	TAAAA	2	10	5150	5159	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008567	A	7	7	5207	5213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008567	AGA	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008567	AGAA	2	8	5232	5239	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008567	AAG	2	6	5243	5248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008567	AGA	2	6	5253	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008567	A	6	6	5284	5289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008567	AAT	2	6	5295	5300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008567	A	7	7	5301	5307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008567	A	6	6	5319	5324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008567	TA	3	6	5542	5547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008567	A	8	8	5575	5582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008567	TTA	2	6	5583	5588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008567	TCA	2	6	5606	5611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008567	A	7	7	5611	5617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008567	AGA	2	6	5626	5631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008567	AT	3	6	5637	5642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008567	T	9	9	5651	5659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008567	A	7	7	5671	5677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008567	AGA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008567	GAA	2	6	5704	5709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008567	T	6	6	6278	6283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008567	T	8	8	6320	6327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008567	TTTA	2	8	6344	6351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008567	ATA	2	6	6371	6376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008567	A	7	7	6386	6392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008567	ACT	2	6	6866	6871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008567	AAATAA	2	12	6925	6936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008567	TAA	3	9	6965	6973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008567	TAT	2	6	6980	6985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008567	AAT	2	6	7003	7008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008567	TA	4	8	7024	7031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008567	TGATAA	2	12	7033	7044	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008567	A	6	6	7083	7088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008567	TAAA	2	8	7143	7150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008567	A	6	6	7148	7153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008567	TAT	2	6	7162	7167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008567	TAA	2	6	7170	7175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008567	TAA	2	6	7183	7188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008567	A	6	6	7207	7212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008567	AT	3	6	7221	7226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008567	TTAA	2	8	7246	7253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008567	ATTT	2	8	7655	7662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008567	AT	3	6	7694	7699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008567	TAG	2	6	8512	8517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008567	TAA	2	6	8524	8529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008567	A	7	7	8548	8554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008567	GGGT	2	8	8677	8684	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008567	AAATA	2	10	8716	8725	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008567	ATTACT	2	12	8729	8740	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_008567	CAAAT	2	10	8742	8751	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008567	TAA	2	6	8881	8886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008567	ATT	2	6	8921	8926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008567	TAAA	2	8	8935	8942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008567	T	7	7	8996	9002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008567	ATTT	2	8	9005	9012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008567	A	6	6	9041	9046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008567	AAG	2	6	9090	9095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008567	GTT	2	6	9100	9105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008567	TCTT	2	8	9119	9126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008567	TA	3	6	9127	9132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008567	AGC	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008567	AAG	2	6	9547	9552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008567	AAG	2	6	9582	9587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008567	TAA	2	6	9616	9621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008567	T	7	7	9669	9675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008567	AT	3	6	9682	9687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008567	TAA	2	6	9699	9704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008567	TTA	2	6	9708	9713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008567	TA	3	6	9712	9717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008567	TA	3	6	9782	9787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008567	ATAA	2	8	9821	9828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_008567	T	7	7	9866	9872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_008567	TAA	2	6	13144	13149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.